Determinarea indiciilor de deteriorare a biodiversității protejate prin DLE se poate face luând în considerare ca STAT starea de conservare a speciei și/sau a habitatului la nivel local (adică în zona în care s-a produs evenimentul), la nivel național și biogeografic, de exemplu pe baza datelor de raportare din Directivele privind habitatele și păsările1 2 3, utilizând parametrii disponibili pentru evaluarea stării de conservare4.
Dacă este implicat un sit Natura 2000, evaluarea trebuie să ia în considerare formularele standard ale Comunității Europene pentru siturile Natura 20005 (Zone de protecție specială (SPA), situri propuse de importanță comunitară (pSCI), situri de importanță comunitară (SCI) și pentru zone speciale de conservare (SAC)).
În cazul în care nu este implicat un sit Natura 2000, o evaluare ar trebui să ia în considerare posibila abatere de la valoarea de referință a unor parametri precum raritatea/densitatea speciei, suprafața acoperită de habitat și rezistența (capacitatea de refacere) a speciilor și habitatelor din sit afectate negativ de factorii de apariție și de daună.
Ar trebui să se facă trimitere la tabelele de IMPACT și STARE pentru determinarea indiciilor și a dovezilor de afectare a biodiversității. Următoarea fig. 14 reprezintă diagrama de flux decizional pentru determinarea indiciilor de deteriorare a biodiversității protejate prin ELD:
Diagrama de flux decizional pentru determinarea indiciilor și a dovezilor de prejudiciere a biodiversității

Figure 14 – Decision-making flowchart for the determination of the clues and evidence of damage to biodiversity.
1 https://cdr.eionet.europa.eu/help/habitats_art17
2 https://cdr.eionet.europa.eu/help/birds_art12
3 https://www.eionet.europa.eu/etcs/etc-bd/activities/reporting
4 A se vedea anexa I la ELD, precum și Directivele privind habitatele și păsările.
5 https://natura2000.eea.europa.eu/Natura2000/SDF.aspx?site=GR2520003#2
2 https://cdr.eionet.europa.eu/help/birds_art12
3 https://www.eionet.europa.eu/etcs/etc-bd/activities/reporting
4 A se vedea anexa I la ELD, precum și Directivele privind habitatele și păsările.
5 https://natura2000.eea.europa.eu/Natura2000/SDF.aspx?site=GR2520003#2