L'argomento Acqua e Territorio comprende i progetti, le linee guida, gli strumenti o i materiali di conoscenza dell'IMPEL che si concentrano sui doveri applicabili direttamente o indirettamente legati a direttive come la Direttiva Quadro sulle Acque, la Direttiva Nitrati, le direttive sulla Strategia Marina; in vista della Legge sulla Salute del Suolo. In questo ambito possono essere seguiti anche progetti relativi alla bonifica delle acque e dei terreni di siti contaminati, alla gestione delle aree minerarie e ad altre minacce per il suolo