Škoda je v ELD definována jako “měřitelná nepříznivá změna přírodního zdroje nebo měřitelné zhoršení služby přírodního zdroje, ke kterému může dojít přímo nebo nepřímo”. Vznik škody nezakládá povinnosti, nicméně podle sdělení EU KOM je chápání pojmu škoda podstatné pro pochopení ekologické újmy.
Oznámení uvádí čtyři pojmy v definici pojmu “škoda”, a to:
1. Věcný rozsah toho, co je zasaženo – přírodní zdroj nebo služba. Přírodní zdroje jsou v ELD dále definovány jako chráněné druhy a přírodní stanoviště, voda a půda. Službou přírodního zdroje se rozumí “funkce, které plní přírodní zdroj ve prospěch jiného přírodního zdroje nebo veřejnosti”.
.
2. Nepříznivé účinky – nepříznivá změna nebo zhoršení samotného přírodního zdroje a služby přírodního zdroje. Nepříznivé účinky pro každý typ ekologické újmy jsou v Oznámení uvedeny s odkazem na určité pojmy, označované v něm jako “referenční pojmy” (viz výše odst. 3.1), z nichž mnohé jsou uvedeny nebo na ně odkazují přílohy I a II ELD. Pojem “škoda” není samostatný a je třeba jej vykládat ve světle definice “škody na životním prostředí”. Proto například poškození služeb, které voda poskytuje, musí být proto doprovázeno významnými nepříznivými účinky na stav dotčených vod.
3. Rozsah nepříznivých účinků – nepříznivá změna nebo zhoršení musí být měřitelné.
4. Způsoby, jakými nepříznivé účinky vznikají – přímo nebo nepřímo, např. přímá aplikace znečišťující látky na půdu nebo do půdy, která má za následek významné riziko pro lidské zdraví, nebo rozptýlení znečišťující látky v ovzduší na půdu, která pak představuje významné riziko pro lidské zdraví nepřímo.
Tyto referenční pojmy jsou obsaženy v příslušných tabulkách IMPACT a STATE tohoto praktického průvodce pro hodnocení stop poškození životního prostředí.